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nvbio::bowtie2::cuda::Stats Member List

This is the complete list of members for nvbio::bowtie2::cuda::Stats, including all inherited members.

alignments_DtoHnvbio::bowtie2::cuda::Stats
backtracknvbio::bowtie2::cuda::Stats
backtrack_oppositenvbio::bowtie2::cuda::Stats
concordantnvbio::bowtie2::cuda::Stats
discordantnvbio::bowtie2::cuda::Stats
finalizenvbio::bowtie2::cuda::Stats
global_timenvbio::bowtie2::cuda::Stats
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hits_top_binsnvbio::bowtie2::cuda::Stats
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hits_totalnvbio::bowtie2::cuda::Stats
ionvbio::bowtie2::cuda::Stats
locatenvbio::bowtie2::cuda::Stats
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mate1nvbio::bowtie2::cuda::Stats
mate2nvbio::bowtie2::cuda::Stats
n_readsnvbio::bowtie2::cuda::Stats
opposite_scorenvbio::bowtie2::cuda::Stats
paramsnvbio::bowtie2::cuda::Stats
read_HtoDnvbio::bowtie2::cuda::Stats
read_ionvbio::bowtie2::cuda::Stats
scorenvbio::bowtie2::cuda::Stats
scoring_pipenvbio::bowtie2::cuda::Stats
selectnvbio::bowtie2::cuda::Stats
sortnvbio::bowtie2::cuda::Stats
Stats(const Params _params=Params())nvbio::bowtie2::cuda::Stats
track_alignment_statistics(const io::BestAlignments &alignment1, const io::BestAlignments &alignment2, const uint8 mapq)nvbio::bowtie2::cuda::Stats
track_alignment_statistics(AlignmentStats *mate, const io::BestAlignments &alignment, const uint8 mapq)nvbio::bowtie2::cuda::Stats