nvbio::io::DebugOutput Member List

This is the complete list of members for nvbio::io::DebugOutput, including all inherited members.

alignment_type	nvbio::io::OutputFile	protected
bnt	nvbio::io::OutputFile	protected
close(void)	nvbio::io::DebugOutput	virtual
configure_mapq_evaluator(int mapq_filter)	nvbio::io::OutputFile	virtual
DebugOutput(const char *file_name, AlignmentType alignment_type, BNT bnt)	nvbio::io::DebugOutput
file_name	nvbio::io::OutputFile	protected
get_aggregate_statistics(void)	nvbio::io::OutputFile	virtual
header()	nvbio::io::OutputFile	inlinevirtual
iostats	nvbio::io::OutputFile	protected
mapq_filter	nvbio::io::OutputFile	protected
open(const char *file_name, AlignmentType aln_type, BNT bnt)	nvbio::io::OutputFile	static
OutputFile(const char *file_name, AlignmentType alignment_type, BNT bnt)	nvbio::io::OutputFile	protected
pg_args	nvbio::io::OutputFile	protected
pg_id	nvbio::io::OutputFile	protected
pg_name	nvbio::io::OutputFile	protected
pg_version	nvbio::io::OutputFile	protected
process(struct HostOutputBatchSE &batch)	nvbio::io::DebugOutput	virtual
process(struct HostOutputBatchPE &batch)	nvbio::io::DebugOutput	virtual
rg_id	nvbio::io::OutputFile	protected
rg_string	nvbio::io::OutputFile	protected
set_program(const char *_pg_id, const char *_pg_name, const char *_pg_version, const char *_pg_args)	nvbio::io::OutputFile	inline
set_rg(const char *_rg_id, const char *_rg_string)	nvbio::io::OutputFile	inline
~DebugOutput()	nvbio::io::DebugOutput
~OutputFile()	nvbio::io::OutputFile	virtual