NVBIO
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nvbio::io::AlignmentData Member List

This is the complete list of members for nvbio::io::AlignmentData, including all inherited members.

AlignmentData()nvbio::io::AlignmentDatainline
AlignmentData(const Alignment *_aln, const uint32 _mapq, const uint32 _aln_id, const uint32 _read_id, const io::SequenceDataHost *read_data_batch, const HostCigarArray *cigar_array, const HostMdsArray *mds_array)nvbio::io::AlignmentDatainline
alnnvbio::io::AlignmentData
aln_idnvbio::io::AlignmentData
cigarnvbio::io::AlignmentData
cigar_array_pnvbio::io::AlignmentData
cigar_lennvbio::io::AlignmentData
cigar_posnvbio::io::AlignmentData
invalid(void)nvbio::io::AlignmentDatainlinestatic
mapqnvbio::io::AlignmentData
mds_array_pnvbio::io::AlignmentData
mds_vecnvbio::io::AlignmentData
qualnvbio::io::AlignmentData
read_access_type typedefnvbio::io::AlignmentData
read_datanvbio::io::AlignmentData
read_data_batch_pnvbio::io::AlignmentData
read_data_type typedefnvbio::io::AlignmentData
read_idnvbio::io::AlignmentData
read_lennvbio::io::AlignmentData
read_namenvbio::io::AlignmentData
read_offsetnvbio::io::AlignmentData
read_type typedefnvbio::io::AlignmentData
validnvbio::io::AlignmentData
Generated on Wed Feb 25 2015 08:34:25 for NVBIO by   doxygen 1.8.4