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nvbio
io
FMIndexData
nvbio::io::FMIndexData Member List
This is the complete list of members for
nvbio::io::FMIndexData
, including all inherited members.
BWT_BIG_ENDIAN
nvbio::io::FMIndexDataCore
static
BWT_BITS
nvbio::io::FMIndexDataCore
static
bwt_iterator
() const
nvbio::io::FMIndexData
inline
bwt_occ
() const
nvbio::io::FMIndexDataCore
inline
bwt_occ_type
typedef
nvbio::io::FMIndexData
bwt_occ_words
() const
nvbio::io::FMIndexDataCore
inline
bwt_stream_type
typedef
nvbio::io::FMIndexData
BWT_SYMBOLS_PER_WORD
nvbio::io::FMIndexDataCore
static
bwt_type
typedef
nvbio::io::FMIndexData
count_table
() const
nvbio::io::FMIndexDataCore
inline
count_table_iterator
() const
nvbio::io::FMIndexData
inline
count_table_type
typedef
nvbio::io::FMIndexData
flags
() const
nvbio::io::FMIndexDataCore
inline
fm_index_type
typedef
nvbio::io::FMIndexData
FMIndexData
()
nvbio::io::FMIndexData
FMIndexDataCore
()
nvbio::io::FMIndexDataCore
inline
FORWARD
nvbio::io::FMIndexDataCore
static
has_rssa
() const
nvbio::io::FMIndexDataCore
inline
has_ssa
() const
nvbio::io::FMIndexDataCore
inline
index
() const
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inline
L2
() const
nvbio::io::FMIndexDataCore
inline
length
() const
nvbio::io::FMIndexDataCore
inline
m_bwt_occ
nvbio::io::FMIndexDataCore
m_bwt_occ_words
nvbio::io::FMIndexDataCore
m_count_table
nvbio::io::FMIndexDataCore
m_flags
nvbio::io::FMIndexDataCore
m_L2
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m_rprimary
nvbio::io::FMIndexDataCore
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m_sa_words
nvbio::io::FMIndexDataCore
m_seq_length
nvbio::io::FMIndexDataCore
m_ssa
nvbio::io::FMIndexDataCore
OCC_INT
nvbio::io::FMIndexDataCore
static
occ_iterator
() const
nvbio::io::FMIndexData
inline
occ_type
typedef
nvbio::io::FMIndexData
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typedef
nvbio::io::FMIndexData
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() const
nvbio::io::FMIndexData
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() const
nvbio::io::FMIndexDataCore
inline
rank_dict
() const
nvbio::io::FMIndexData
inline
rank_dict_type
typedef
nvbio::io::FMIndexData
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() const
nvbio::io::FMIndexData
inline
rbwt_occ
() const
nvbio::io::FMIndexDataCore
inline
REVERSE
nvbio::io::FMIndexDataCore
static
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() const
nvbio::io::FMIndexData
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() const
nvbio::io::FMIndexData
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() const
nvbio::io::FMIndexData
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() const
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() const
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() const
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() const
nvbio::io::FMIndexData
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SA
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static
SA_INT
nvbio::io::FMIndexDataCore
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sa_words
() const
nvbio::io::FMIndexDataCore
inline
ssa
() const
nvbio::io::FMIndexDataCore
inline
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() const
nvbio::io::FMIndexData
inline
ssa_storage_type
typedef
nvbio::io::FMIndexData
ssa_type
typedef
nvbio::io::FMIndexDataCore
~FMIndexData
()
nvbio::io::FMIndexData
inline
virtual
Generated on Wed Feb 25 2015 08:34:21 for NVBIO by
1.8.4