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nvbio::io::FMIndexDataDevice Member List

This is the complete list of members for nvbio::io::FMIndexDataDevice, including all inherited members.

allocated() const nvbio::io::FMIndexDataDeviceinline
BWT_BIG_ENDIANnvbio::io::FMIndexDataCorestatic
BWT_BITSnvbio::io::FMIndexDataCorestatic
bwt_iterator() const nvbio::io::FMIndexDataDeviceinline
bwt_occ() const nvbio::io::FMIndexDataCoreinline
bwt_occ_type typedefnvbio::io::FMIndexDataDevice
bwt_occ_words() const nvbio::io::FMIndexDataCoreinline
bwt_stream_type typedefnvbio::io::FMIndexDataDevice
BWT_SYMBOLS_PER_WORDnvbio::io::FMIndexDataCorestatic
bwt_type typedefnvbio::io::FMIndexDataDevice
count_table() const nvbio::io::FMIndexDataCoreinline
count_table_iterator() const nvbio::io::FMIndexDataDeviceinline
count_table_type typedefnvbio::io::FMIndexDataDevice
flags() const nvbio::io::FMIndexDataCoreinline
fm_index_type typedefnvbio::io::FMIndexDataDevice
FMIndexData()nvbio::io::FMIndexData
FMIndexDataCore()nvbio::io::FMIndexDataCoreinline
FMIndexDataDevice(const FMIndexData &host_data, const uint32 flags=FORWARD|REVERSE)nvbio::io::FMIndexDataDevice
FORWARDnvbio::io::FMIndexDataDevicestatic
has_rssa() const nvbio::io::FMIndexDataCoreinline
has_ssa() const nvbio::io::FMIndexDataCoreinline
index() const nvbio::io::FMIndexDataDeviceinline
L2() const nvbio::io::FMIndexDataCoreinline
length() const nvbio::io::FMIndexDataCoreinline
m_bwt_occnvbio::io::FMIndexDataCore
m_bwt_occ_wordsnvbio::io::FMIndexDataCore
m_count_tablenvbio::io::FMIndexDataCore
m_flagsnvbio::io::FMIndexDataCore
m_L2nvbio::io::FMIndexDataCore
m_primarynvbio::io::FMIndexDataCore
m_rbwt_occnvbio::io::FMIndexDataCore
m_rprimarynvbio::io::FMIndexDataCore
m_rssanvbio::io::FMIndexDataCore
m_sa_wordsnvbio::io::FMIndexDataCore
m_seq_lengthnvbio::io::FMIndexDataCore
m_ssanvbio::io::FMIndexDataCore
OCC_INTnvbio::io::FMIndexDataCorestatic
occ_iterator() const nvbio::io::FMIndexDataDeviceinline
occ_type typedefnvbio::io::FMIndexDataDevice
partial_fm_index_type typedefnvbio::io::FMIndexDataDevice
partial_index() const nvbio::io::FMIndexDataDeviceinline
primary() const nvbio::io::FMIndexDataCoreinline
rank_dict() const nvbio::io::FMIndexDataDeviceinline
rank_dict_type typedefnvbio::io::FMIndexDataDevice
rbwt_iterator() const nvbio::io::FMIndexDataDeviceinline
rbwt_occ() const nvbio::io::FMIndexDataCoreinline
REVERSEnvbio::io::FMIndexDataDevicestatic
rindex() const nvbio::io::FMIndexDataDeviceinline
rocc_iterator() const nvbio::io::FMIndexDataDeviceinline
rpartial_index() const nvbio::io::FMIndexDataDeviceinline
rprimary() const nvbio::io::FMIndexDataCoreinline
rrank_dict() const nvbio::io::FMIndexDataDeviceinline
rssa() const nvbio::io::FMIndexDataCoreinline
rssa_iterator() const nvbio::io::FMIndexDataDeviceinline
SAnvbio::io::FMIndexDataDevicestatic
SA_INTnvbio::io::FMIndexDataCorestatic
sa_words() const nvbio::io::FMIndexDataCoreinline
ssa() const nvbio::io::FMIndexDataCoreinline
ssa_iterator() const nvbio::io::FMIndexDataDeviceinline
ssa_ldg_type typedefnvbio::io::FMIndexDataDevice
ssa_storage_type typedefnvbio::io::FMIndexDataDevice
ssa_type typedefnvbio::io::FMIndexDataDevice
~FMIndexData()nvbio::io::FMIndexDatainlinevirtual
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