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nvbio::io::FMIndexDataMMAP Member List

This is the complete list of members for nvbio::io::FMIndexDataMMAP, including all inherited members.

BWT_BIG_ENDIANnvbio::io::FMIndexDataCorestatic
BWT_BITSnvbio::io::FMIndexDataCorestatic
bwt_iterator() const nvbio::io::FMIndexDatainline
bwt_occ() const nvbio::io::FMIndexDataCoreinline
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bwt_occ_words() const nvbio::io::FMIndexDataCoreinline
bwt_stream_type typedefnvbio::io::FMIndexData
BWT_SYMBOLS_PER_WORDnvbio::io::FMIndexDataCorestatic
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count_table_iterator() const nvbio::io::FMIndexDatainline
count_table_type typedefnvbio::io::FMIndexData
flags() const nvbio::io::FMIndexDataCoreinline
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FMIndexData()nvbio::io::FMIndexData
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FORWARDnvbio::io::FMIndexDataCorestatic
has_rssa() const nvbio::io::FMIndexDataCoreinline
has_ssa() const nvbio::io::FMIndexDataCoreinline
index() const nvbio::io::FMIndexDatainline
Info typedefnvbio::io::FMIndexDataMMAP
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length() const nvbio::io::FMIndexDataCoreinline
load(const char *genome_name)nvbio::io::FMIndexDataMMAP
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OCC_INTnvbio::io::FMIndexDataCorestatic
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REVERSEnvbio::io::FMIndexDataCorestatic
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SAnvbio::io::FMIndexDataCorestatic
SA_INTnvbio::io::FMIndexDataCorestatic
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ssa() const nvbio::io::FMIndexDataCoreinline
ssa_iterator() const nvbio::io::FMIndexDatainline
ssa_storage_type typedefnvbio::io::FMIndexData
ssa_type typedefnvbio::io::FMIndexDataCore
~FMIndexData()nvbio::io::FMIndexDatainlinevirtual
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