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nvbio::io::ReadDataFile_BAM Member List

This is the complete list of members for nvbio::io::ReadDataFile_BAM, including all inherited members.

FILE_EOF enum valuenvbio::io::ReadDataFile
FILE_NOT_READY enum valuenvbio::io::ReadDataFile
FILE_OK enum valuenvbio::io::ReadDataFile
FILE_OPEN_FAILED enum valuenvbio::io::ReadDataFile
FILE_PARSE_ERROR enum valuenvbio::io::ReadDataFile
FILE_STREAM_ERROR enum valuenvbio::io::ReadDataFile
FileState enum namenvbio::io::ReadDataFile
init(void)nvbio::io::ReadDataFile_BAM
is_ok(void)nvbio::io::ReadDataFileinlinevirtual
LONG_READnvbio::io::ReadDataFilestatic
m_file_statenvbio::io::ReadDataFileprotected
m_flagsnvbio::io::ReadDataFileprotected
m_loadednvbio::io::ReadDataFileprotected
m_max_readsnvbio::io::ReadDataFileprotected
m_truncate_read_lennvbio::io::ReadDataStream
next(const uint32 batch_size, const uint32 batch_bps)nvbio::io::ReadDataFilevirtual
nextChunk(ReadDataRAM *output, uint32 max_reads, uint32 max_bps)nvbio::io::ReadDataFile_BAMvirtual
ReadDataFile(const uint32 max_reads, const uint32 truncate_read_len, const ReadEncoding flags)nvbio::io::ReadDataFileinlineprotected
ReadDataFile_BAM(const char *read_file_name, const uint32 max_reads, const uint32 max_read_len, const ReadEncoding flags)nvbio::io::ReadDataFile_BAM
ReadDataStream(uint32 truncate_read_len=uint32(-1))nvbio::io::ReadDataStreaminline
~ReadDataFile()nvbio::io::ReadDataFileinlinevirtual
~ReadDataStream()nvbio::io::ReadDataStreaminlinevirtual