- _ -

• _dist_code : deflate.h , trees.c , trees.h
• _length_code : deflate.h , trees.c , trees.h

- b -

• base_dist : trees.c , trees.h
• base_length : trees.h , trees.c
• bcf_float_missing : vcf.h
• bcf_float_vector_end : vcf.h
• bcf_type_shift : vcf.h
• bl_order : trees.c

- c -

• configuration_table : deflate.c
• crc_table : crc32.h
• crcTable : crc.cpp , crc.h

- d -

• deflate_copyright : deflate.c

- e -

• extra_blbits : trees.c
• extra_dbits : trees.c
• extra_lbits : trees.c

- h -

• hts_verbose : hts.c , hts.h

- i -

• inflate_copyright : inftrees.c

- l -

• lidx_t : hts.c

- m -

• m_index_vec : sequence_pac.cpp
• m_info : sequence_pac.cpp
• m_name_index_vec : sequence_pac.cpp
• m_name_vec : sequence_pac.cpp
• m_options : sequence_fasta.cpp
• m_output : sequence_fasta.cpp
• m_quals : sequence_fasta.cpp

- s -

• s_verbosity : console.cpp
• seq_nt16_str : hts.c , hts.h
• seq_nt16_table : hts.c , hts.h
• static_bl_desc : trees.c
• static_d_desc : trees.c
• static_dtree : trees.h , trees.c
• static_l_desc : trees.c
• static_ltree : trees.h , trees.c

- t -

• tbx_conf_bed : tbx.h , tbx.c
• tbx_conf_gff : tbx.c , tbx.h
• tbx_conf_psltbl : tbx.h , tbx.c
• tbx_conf_sam : tbx.c , tbx.h
• tbx_conf_vcf : tbx.h , tbx.c
• TEXT_BLUE : console.cpp
• TEXT_BRIGHT : console.cpp
• TEXT_BRIGHT_BLUE : console.cpp
• TEXT_BRIGHT_MAGENTA : console.cpp
• TEXT_BRIGHT_RED : console.cpp
• TEXT_CYAN : console.cpp
• TEXT_GREEN : console.cpp
• TEXT_NORMAL : console.cpp
• TEXT_RED : console.cpp

- z -

• z_errmsg : zutil.c , zutil.h