- a -

• AlignmentFlags : nvbio::io
• AlignmentMate : nvbio::io
• AlignmentScore : nvbio::io
• AlignmentStreamType : nvbio::bowtie2::cuda::detail
• AlignmentTest : nvbio::aln
• AlignmentType : nvbio::aln , nvbio::io , nvbio::bowtie2::cuda
• Alphabet : nvbio

- b -

• Bins : nvbio::alndiff
• block_strided_layout : nvbio

- c -

• CacheLoadModifier : nvbio::cuda
• CostType : nvbio::bowtie2::cuda

- d -

• DirectionVector : nvbio::aln
• DirType : nvbio

- e -

• EndType : nvbio::bowtie2::cuda

- f -

• Formatting : nvbio::html

- m -

• MappingAlgorithm : nvbio::bowtie2::cuda::detail
• MappingMode : nvbio::bowtie2::cuda
• MateType : nvbio::bowtie2::cuda
• MDS_OP : nvbio::io
• MgpuBounds : mgpu
• MgpuJoinKind : mgpu
• MgpuScanType : mgpu
• MgpuSearchType : mgpu
• MgpuSetOp : mgpu

- p -

• PairedEndPolicy : nvbio::io

- q -

• QualityEncoding : nvbio::io

- r -

• ReadEncoding : nvbio::io
• ReadType : nvbio

- s -

• ScoringMode : nvbio::bowtie2::cuda
• SequenceEncoding : nvbio::io
• SequenceFlags : nvbio::io
• State : nvbio::aln
• SuffixComponent : nvbio::priv

- t -

• TrieType : nvbio
• Type : nvbio::alndiff

- w -

• WorkQueueStatsEvent : nvbio::cuda