- s -

• S_ISDIR : files.c
• S_ISREG : files.c
• sam_close : sam.h
• sam_itr_destroy : sam.h
• sam_itr_next : sam.h
• sam_open : sam.h
• SEEK_CUR : zconf.h
• SEEK_END : zconf.h
• SEEK_SET : zconf.h
• send_bits : trees.c
• send_code : trees.c
• SEQS_PER_SLICE : cram_structs.h
• SET : md5.c
• set_d : ssw.cpp
• set_u : ssw.cpp
• SINGLE_CTA_SCAN : work_queue_ordered_inl.h
• SLICE_PER_CNT : cram_structs.h
• smaller : trees.c
• SMALLEST : trees.c
• SP_LITTLE_ENDIAN : os.h
• SS_BLOCKSIZE : divsufsort.c
• SS_INSERTIONSORT_THRESHOLD : divsufsort.c
• SS_MISORT_STACKSIZE : divsufsort.c
• SS_SMERGE_STACKSIZE : divsufsort.c
• STACK_POP : divsufsort.c
• STACK_POP3 : divsufsortxx.h
• STACK_POP4 : divsufsortxx.h
• STACK_POP5 : divsufsort.c
• STACK_PUSH : divsufsort.c
• STACK_PUSH3 : divsufsortxx.h
• STACK_PUSH4 : divsufsortxx.h
• STACK_PUSH5 : divsufsort.c
• STACK_SIZE : divsufsort.c
• STATIC_TREES : zutil.h
• STEP : md5.c
• STEPSIZE : lz4.c
• STORED_BLOCK : zutil.h
• STRAT2 : cram_encode.c
• STRNCMP : sam.c
• SW_BWD : vcf_sweep.c
• SW_F_INITIALIZED_TO_INF : gotoh_banded_inl.h
• SW_FWD : vcf_sweep.c
• SWAP : divsufsort.c