Here is a list of all file members with links to the files they belong to:

- l -

• L_CODES : deflate.h
• LASTLITERALS : lz4.c
• lbnode_t : sam.c
• le_int4 : os.h
• LEN : inflate.h
• Len : deflate.h
• LEN_ : inflate.h
• LENEXT : inflate.h
• LENGTH : inflate.h
• LENGTH_CODES : deflate.h
• LENLENS : inflate.h
• LENS : inftrees.h
• LEVEL2 : cram_encode.c
• lidx_t : hts.c
• LIKELY : ssw.cpp , cpu.cpp
• likely : lz4.c
• limitedOutput : lz4.c , lz4hc.c
• limitedOutput_directive : lz4.c , lz4hc.c
• list_files() : filelist.cpp , filelist.h
• LIT : inflate.h
• LITERALS : deflate.h
• lm_init() : deflate.c
• LOAD : infback.c , inflate.c
• local : zutil.h , adler32.c , crc32.c , gzguts.h
• local_assembly() : assembly.h
• log_debug() : console.cpp , console.h
• log_debug_cont() : console.cpp , console.h
• log_debug_nl() : console.cpp , console.h
• log_ed() : nvBowtie.cpp
• log_error() : console.cpp , console.h
• log_error_cont() : console.cpp , console.h
• log_error_nl() : console.cpp , console.h
• log_info() : console.cpp , console.h
• log_info_cont() : console.cpp , console.h
• log_info_nl() : console.cpp , console.h
• log_mapq() : nvBowtie.cpp
• log_stats() : console.cpp , console.h
• log_stats_cont() : console.cpp , console.h
• log_stats_nl() : console.cpp , console.h
• log_verbose() : console.cpp , console.h
• log_verbose_cont() : console.cpp , console.h
• log_verbose_nl() : console.cpp , console.h
• log_visible() : console.cpp , console.h
• log_visible_cont() : console.cpp , console.h
• log_visible_nl() : console.cpp , console.h
• log_warning() : console.cpp , console.h
• log_warning_cont() : console.cpp , console.h
• log_warning_nl() : console.cpp , console.h
• longest_match() : deflate.c
• LOOK : gzguts.h
• LSEEK : gzlib.c
• ltf8_decode() : cram_io.c
• ltf8_get() : cram_io.c
• ltf8_put() : cram_io.c
• LZ4_COMMONDEFS_ONLY : lz4hc.c
• LZ4_compress() : lz4.c , lz4.h
• LZ4_compress_continue() : lz4.c , lz4.h
• LZ4_compress_continue_generic() : lz4.c
• LZ4_compress_forceExtDict() : lz4.c
• LZ4_compress_limitedOutput() : lz4.c , lz4.h
• LZ4_compress_limitedOutput_continue() : lz4.c , lz4.h
• LZ4_compress_limitedOutput_withState() : lz4.c , lz4.h
• LZ4_compress_withState() : lz4.c , lz4.h
• LZ4_COMPRESSBOUND : lz4.h
• LZ4_compressBound() : lz4.c , lz4.h
• LZ4_compressHC() : lz4hc.c , lz4hc.h
• LZ4_compressHC2() : lz4hc.c , lz4hc.h
• LZ4_compressHC2_continue() : lz4hc.c , lz4hc.h
• LZ4_compressHC2_limitedOutput() : lz4hc.c , lz4hc.h
• LZ4_compressHC2_limitedOutput_continue() : lz4hc.c , lz4hc.h
• LZ4_compressHC2_limitedOutput_withStateHC() : lz4hc.c , lz4hc.h
• LZ4_compressHC2_withStateHC() : lz4hc.c , lz4hc.h
• LZ4_compressHC_continue() : lz4hc.c , lz4hc.h
• LZ4_compressHC_limitedOutput() : lz4hc.c , lz4hc.h
• LZ4_compressHC_limitedOutput_continue() : lz4hc.c , lz4hc.h
• LZ4_compressHC_limitedOutput_withStateHC() : lz4hc.c , lz4hc.h
• LZ4_compressHC_withStateHC() : lz4hc.c , lz4hc.h
• LZ4_create() : lz4.c , lz4.h
• LZ4_createHC() : lz4hc.c , lz4hc.h
• LZ4_createStream() : lz4.c , lz4.h
• LZ4_createStreamDecode() : lz4.c , lz4.h
• LZ4_createStreamHC() : lz4hc.c , lz4hc.h
• LZ4_decompress_fast() : lz4.c , lz4.h
• LZ4_decompress_fast_continue() : lz4.c , lz4.h
• LZ4_decompress_fast_usingDict() : lz4.c , lz4.h
• LZ4_decompress_fast_withPrefix64k() : lz4.c , lz4.h
• LZ4_decompress_generic() : lz4.c
• LZ4_decompress_safe() : lz4.c , lz4.h
• LZ4_decompress_safe_continue() : lz4.c , lz4.h
• LZ4_decompress_safe_forceExtDict() : lz4.c
• LZ4_decompress_safe_partial() : lz4.c , lz4.h
• LZ4_decompress_safe_usingDict() : lz4.c , lz4.h
• LZ4_decompress_safe_withPrefix64k() : lz4.c , lz4.h
• LZ4_decompress_usingDict_generic() : lz4.c
• LZ4_freeHC() : lz4hc.c , lz4hc.h
• LZ4_freeStream() : lz4.h , lz4.c
• LZ4_freeStreamDecode() : lz4.c , lz4.h
• LZ4_freeStreamHC() : lz4hc.c , lz4hc.h
• LZ4_HASHLOG : lz4.c
• LZ4_loadDict() : lz4.c , lz4.h
• LZ4_loadDictHC() : lz4hc.c , lz4hc.h
• LZ4_MAX_INPUT_SIZE : lz4.h
• LZ4_MEMORY_USAGE : lz4.h
• LZ4_resetStream() : lz4.c , lz4.h
• LZ4_resetStreamHC() : lz4hc.c , lz4hc.h
• LZ4_resetStreamState() : lz4.c , lz4.h
• LZ4_resetStreamStateHC() : lz4hc.c , lz4hc.h
• LZ4_saveDict() : lz4.h , lz4.c
• LZ4_saveDictHC() : lz4hc.c , lz4hc.h
• LZ4_setStreamDecode() : lz4.h , lz4.c
• LZ4_sizeofState() : lz4.h , lz4.c
• LZ4_sizeofStateHC() : lz4hc.h , lz4hc.c
• LZ4_sizeofStreamState() : lz4.c , lz4.h
• LZ4_sizeofStreamStateHC() : lz4hc.c , lz4hc.h
• LZ4_slideInputBuffer() : lz4.c , lz4.h
• LZ4_slideInputBufferHC() : lz4hc.c , lz4hc.h
• LZ4_STATIC_ASSERT : lz4.c
• LZ4_STREAMDECODESIZE : lz4.h
• LZ4_STREAMDECODESIZE_U64 : lz4.h
• LZ4_STREAMHCSIZE : lz4hc.h
• LZ4_STREAMHCSIZE_U64 : lz4hc.h
• LZ4_STREAMSIZE : lz4.h
• LZ4_STREAMSIZE_U64 : lz4.h
• LZ4_UNALIGNED_ACCESS : lz4.c
• LZ4_uncompress() : lz4.c
• LZ4_uncompress_unknownOutputSize() : lz4.c
• LZ4_VERSION_MAJOR : lz4.h
• LZ4_VERSION_MINOR : lz4.h
• LZ4_VERSION_NUMBER : lz4.h
• LZ4_VERSION_RELEASE : lz4.h
• LZ4_versionNumber() : lz4.c , lz4.h
• LZ4F_BLOCKSIZEID_DEFAULT : lz4frame.c
• LZ4F_BLOCKUNCOMPRESSED_FLAG : lz4frame.c
• LZ4F_compressBegin() : lz4frame.c , lz4frame.h
• LZ4F_compressBound() : lz4frame.c , lz4frame.h
• LZ4F_compressEnd() : lz4frame.h , lz4frame.c
• LZ4F_compressFrame() : lz4frame.h , lz4frame.c
• LZ4F_compressFrameBound() : lz4frame.h , lz4frame.c
• LZ4F_compressionContext_t : lz4frame.h
• LZ4F_compressUpdate() : lz4frame.c , lz4frame.h
• LZ4F_createCompressionContext() : lz4frame.h , lz4frame.c
• LZ4F_createDecompressionContext() : lz4frame.c , lz4frame.h
• LZ4F_decompress() : lz4frame.h , lz4frame.c
• LZ4F_decompressionContext_t : lz4frame.h
• LZ4F_default : lz4frame.h
• LZ4F_errorCode_t : lz4frame.h
• LZ4F_errorCodes : lz4frame_static.h
• LZ4F_flush() : lz4frame.c , lz4frame.h
• LZ4F_freeCompressionContext() : lz4frame.c , lz4frame.h
• LZ4F_freeDecompressionContext() : lz4frame.c , lz4frame.h
• LZ4F_GENERATE_ENUM : lz4frame_static.h
• LZ4F_GENERATE_STRING : lz4frame.c
• LZ4F_getErrorName() : lz4frame.h , lz4frame.c
• LZ4F_getFrameInfo() : lz4frame.c , lz4frame.h
• LZ4F_isError() : lz4frame.h , lz4frame.c
• LZ4F_lastBlockStatus : lz4frame.c
• LZ4F_LIST_ERRORS : lz4frame_static.h
• LZ4F_MAGICNUMBER : lz4frame.c
• LZ4F_MAXHEADERFRAME_SIZE : lz4frame.c
• LZ4F_VERSION : lz4frame.h
• LZ4HC_DEBUG : lz4hc.c
• LZ4HC_encodeSequence() : lz4hc.c
• LZ4HC_Insert() : lz4hc.c
• LZ4HC_InsertAndFindBestMatch() : lz4hc.c
• LZ4HC_InsertAndGetWiderMatch() : lz4hc.c