Here is a list of all file members with links to the files they belong to:

- h -

• H : md5.c
• H_BATCH_SIZE_ALLOC : bam_io.h
• H_ConstStreamDNA : assembly_types.h
• H_KmerIterator : assembly_types.h
• H_RefRangesSet : assembly_types.h
• H_SequenceSet : assembly_types.h
• H_StreamDNA : assembly_types.h
• H_VectorActiveRegions : regions.h
• H_VectorCigarOp : assembly_types.h
• H_VectorCRQIndex : bam_io.h
• H_VectorDNA : assembly_types.h
• H_VectorDNA16 : assembly_types.h
• H_VectorI32 : assembly_types.h
• H_VectorSetKmerCoord : assembly_types.h
• H_VectorU16 : assembly_types.h
• H_VectorU32 : assembly_types.h
• H_VectorU64 : assembly_types.h
• H_VectorU64_2 : assembly_types.h
• H_VectorU8 : assembly_types.h
• HASH_FUNCTION : lz4hc.c
• HASH_LOG : lz4hc.c
• HASH_MASK : lz4hc.c
• HASH_SIZE_U32 : lz4.c
• HASHTABLESIZE : lz4.c , lz4hc.c
• hclose() : hfile.c , hfile.h
• hclose_abruptly : cram_io.c , hfile.c , hfile.h
• HCRC : inflate.h
• HCRC_STATE : deflate.h
• hdopen() : hfile.c , hfile.h
• HEAD : inflate.h
• HEADER_ONLY : tabix.c
• HEAP_SIZE : deflate.h
• HEAPMODE : lz4.c
• hFILE : hfile.h
• hfile_destroy() : hfile.c , hfile_internal.h
• hfile_init() : hfile.c , hfile_internal.h
• hfile_oflags() : hfile.c , hfile_internal.h
• hflush : cram_io.c , hfile.c , hfile.h
• hgetc : cram_io.c
• hgetc2() : hfile.c
• hopen() : hfile.c , hfile.h
• hopen_net() : hfile_internal.h , hfile_net.c
• hpeek() : hfile.c , hfile.h
• hputc : cram_io.c
• hputc2() : hfile.c
• hputs2() : hfile.c
• hread : cram_io.c
• hread2() : hfile.c
• hrec_add_idx() : vcf.c
• hseek() : hfile.c , hfile.h , cram_io.c
• HTS_BGZF_TYPEDEF : bgzf.h , hts.h
• hts_bin_first : hts.h
• hts_bin_parent : hts.h
• hts_close() : hts.c , hts.h
• hts_cram_idx_t : sam.c
• hts_expand : hts.h
• hts_expand0 : hts.h
• hts_file_type() : hts.c , hts.h
• HTS_FMT_BAI : hts.h
• HTS_FMT_CRAI : hts.h
• HTS_FMT_CSI : hts.h
• HTS_FMT_TBI : hts.h
• hts_get_bgzfp() : hts.c , tbx.h , vcf_sweep.c
• hts_getline() : hts.c , hts.h
• hts_id2name_f : hts.h
• hts_idx_destroy() : hts.c , hts.h
• hts_idx_finish() : hts.c , hts.h
• hts_idx_get_meta() : hts.c , hts.h
• hts_idx_get_n_no_coor() : hts.c , hts.h
• hts_idx_get_stat() : hts.h , hts.c
• hts_idx_getfn() : hts.c
• hts_idx_init() : hts.c , hts.h
• hts_idx_load() : hts.c , hts.h
• hts_idx_load_local() : hts.c
• HTS_IDX_NOCOOR : hts.h
• HTS_IDX_NONE : hts.h
• hts_idx_push() : hts.h , hts.c
• HTS_IDX_REST : hts.h
• hts_idx_save() : hts.h , hts.c
• hts_idx_seqnames() : hts.c , hts.h
• hts_idx_set_meta() : hts.c , hts.h
• HTS_IDX_START : hts.h
• hts_idx_t : hts.h
• hts_itr_destroy() : hts.h , hts.c
• hts_itr_next() : hts.c , hts.h
• hts_itr_query() : hts.h , hts.c
• hts_itr_query_func : hts.h
• hts_itr_querys() : hts.c , hts.h
• HTS_MIN_MARKER_DIST : hts.c
• hts_name2id_f : hts.h
• HTS_NORETURN : hts_defs.h
• hts_open() : hts.c , hts.h
• hts_parse_reg() : hts.h , hts.c
• hts_readlines() : hts.h , hts.c
• hts_readlist() : hts.h , hts.c
• hts_readrec_func : hts.h
• HTS_RESULT_USED : hts_defs.h
• hts_set_fai_filename() : hts.c , hts.h
• hts_set_threads() : hts.h , hts.c
• HTS_UNUSED : hts_defs.h
• hts_useek() : vcf_sweep.c , hts.c
• hts_utell() : hts.c , vcf_sweep.c
• hts_verbose : hts.c , hts.h
• hts_version() : hts.h , hts.c
• HTS_VERSION : version.h
• hwrite : cram_io.c
• hwrite2() : hfile.c