Here is a list of all file members with links to the files they belong to:

- m -

• m_index_vec : sequence_pac.cpp
• m_info : sequence_pac.cpp
• M_INV_PIf : numbers.h
• m_name_index_vec : sequence_pac.cpp
• m_name_vec : sequence_pac.cpp
• m_options : sequence_fasta.cpp
• m_output : sequence_fasta.cpp
• M_PI : numbers.h
• M_PI_2 : numbers.h
• M_PI_2f : numbers.h
• M_PIf : numbers.h
• m_quals : sequence_fasta.cpp
• main() : main.cpp , nvbio-aln-diff.cpp , nvbio-test.cpp , nvBowtie.cpp , nvFM-server.cpp , nvSSA.cpp , nvbio-less.cpp , bgzip.c , tabix.c , suftest.c
• MAPPED_SLICE : cram_structs.h
• MATCH : inflate.h
• MatrixMarketBanner : mmio.h
• MAX : misc.h , vlen.c , divsufsort.c
• max16 : ssw.cpp
• max1MB : lz4frame.h
• max256KB : lz4frame.h
• max4MB : lz4frame.h
• max64KB : lz4frame.h
• max8 : ssw.cpp
• MAX_BITS : deflate.h
• MAX_BL_BITS : trees.c
• MAX_CSI_COOR : synced_bcf_reader.c
• MAX_DIST : deflate.h
• MAX_DISTANCE : lz4.c
• MAX_HUFF : cram_codecs.h
• MAX_IN_DEGREE : assembly_graph_inl.h
• max_insert_length : deflate.h
• MAX_MATCH : zutil.h
• MAX_MEM_LEVEL : zconf.h
• MAX_READ_LENGTH : utils.h
• MAX_STAT_VAL : cram_structs.h
• MAX_TEMP_SPACE_BATCHES : kmers.h
• MAX_WBITS : zconf.h
• MAXBITS : inftrees.c
• MAXD : lz4hc.c
• MAXD_LOG : lz4.c
• MAXD_MASK : lz4hc.c
• MB : lz4.c , lz4frame.c
• MD5_Final() : md5.c , md5.h
• MD5_Init() : md5.c , md5.h
• MD5_u32plus : md5.h
• MD5_Update() : md5.c , md5.h
• MEM : inflate.h
• MEM_INIT : lz4.c , lz4frame.c
• merge() : bloom_filters.h
• MERGE_CHECK : divsufsort.c , divsufsortxx.h
• merged_stats() : bloom_filters.h
• META_BIN : hts.c
• MF_APPEND : mFILE.h
• MF_BINARY : mFILE.h
• MF_MODEX : mFILE.h
• MF_READ : mFILE.h
• MF_TRUNC : mFILE.h
• MF_WRITE : mFILE.h
• mfascii() : mFILE.c , mFILE.h
• mfclose() : mFILE.c , mFILE.h
• mfcreate() : mFILE.c , mFILE.h
• mfcreate_from() : mFILE.c , mFILE.h
• mfdestroy() : mFILE.c , mFILE.h
• mfdetach() : mFILE.c , mFILE.h
• mfeof() : mFILE.c , mFILE.h
• mfflush() : mFILE.c , mFILE.h
• mfgetc() : mFILE.c , mFILE.h
• mfgets() : mFILE.c , mFILE.h
• MFLIMIT : lz4.c
• mfopen() : mFILE.c , mFILE.h
• mfprintf() : mFILE.c , mFILE.h
• mfread() : mFILE.c , mFILE.h
• mfrecreate() : mFILE.c , mFILE.h
• mfreopen() : mFILE.c , mFILE.h
• mfseek() : mFILE.c , mFILE.h
• mfsteal() : mFILE.c , mFILE.h
• mftell() : mFILE.c , mFILE.h
• mftruncate() : mFILE.c , mFILE.h
• mfwrite() : mFILE.c , mFILE.h
• MGPU_ABS : static.h
• MGPU_DIV_ROUND : static.h
• MGPU_DIV_UP : static.h
• MGPU_IS_POW_2 : static.h
• MGPU_MAX : static.h
• MGPU_MAX0 : static.h
• MGPU_MEM : mgpucontext.h
• MGPU_MIN : static.h
• MGPU_RAND_NS : mgpuutil.cpp
• MGPU_ROUND_DOWN_POW2 : static.h
• MGPU_ROUND_UP : static.h
• MGPU_ROUND_UP_POW2 : static.h
• MGPU_SHIFT_DIV_UP : static.h
• MGPU_SYNC_CHECK : mgpucontext.h
• MIN : divsufsort.c , misc.h
• MIN_LOOKAHEAD : deflate.h
• MIN_MATCH : zutil.h
• MIN_STR_SIZE : string_alloc.c
• MINMATCH : lz4.c
• mkdir_prefix() : cram_io.c
• ML_BITS : lz4.c
• ML_MASK : lz4.c
• MM_ARRAY_STR : mmio.h
• mm_clear_typecode : mmio.h
• MM_COMPLEX_STR : mmio.h
• MM_COORDINATE_STR : mmio.h
• MM_COULD_NOT_READ_FILE : mmio.h
• MM_COULD_NOT_WRITE_FILE : mmio.h
• MM_DENSE_STR : mmio.h
• MM_GENERAL_STR : mmio.h
• MM_HERM_STR : mmio.h
• mm_initialize_typecode : mmio.h
• MM_INT_STR : mmio.h
• mm_is_array : mmio.h
• mm_is_complex : mmio.h
• mm_is_coordinate : mmio.h
• mm_is_dense : mmio.h
• mm_is_general : mmio.h
• mm_is_hermitian : mmio.h
• mm_is_integer : mmio.h
• mm_is_matrix : mmio.h
• mm_is_pattern : mmio.h
• mm_is_real : mmio.h
• mm_is_skew : mmio.h
• mm_is_sparse : mmio.h
• mm_is_symmetric : mmio.h
• mm_is_valid() : mmio.cpp , mmio.h
• MM_LINE_TOO_LONG : mmio.h
• MM_MAX_LINE_LENGTH : mmio.h
• MM_MAX_TOKEN_LENGTH : mmio.h
• MM_MTX_STR : mmio.h
• MM_NO_HEADER : mmio.h
• MM_NOT_MTX : mmio.h
• MM_PATTERN_STR : mmio.h
• MM_PREMATURE_EOF : mmio.h
• mm_read_banner() : mmio.h , mmio.cpp
• mm_read_mtx_array_size() : mmio.h , mmio.cpp
• mm_read_mtx_crd() : mmio.cpp
• mm_read_mtx_crd_data() : mmio.cpp , mmio.h
• mm_read_mtx_crd_entry() : mmio.cpp , mmio.h
• mm_read_mtx_crd_size() : mmio.cpp , mmio.h
• mm_read_unsymmetric_sparse() : mmio.cpp , mmio.h
• MM_REAL_STR : mmio.h
• mm_set_array : mmio.h
• mm_set_complex : mmio.h
• mm_set_coordinate : mmio.h
• mm_set_dense : mmio.h
• mm_set_general : mmio.h
• mm_set_hermitian : mmio.h
• mm_set_integer : mmio.h
• mm_set_matrix : mmio.h
• mm_set_pattern : mmio.h
• mm_set_real : mmio.h
• mm_set_skew : mmio.h
• mm_set_sparse : mmio.h
• mm_set_symmetric : mmio.h
• MM_SKEW_STR : mmio.h
• MM_SPARSE_STR : mmio.h
• mm_strdup() : mmio.cpp
• MM_SYMM_STR : mmio.h
• MM_typecode : mmio.h
• mm_typecode_to_str() : mmio.cpp , mmio.h
• MM_UNSUPPORTED_TYPE : mmio.h
• mm_write_banner() : mmio.h , mmio.cpp
• mm_write_mtx_array_size() : mmio.h , mmio.cpp
• mm_write_mtx_crd() : mmio.h , mmio.cpp
• mm_write_mtx_crd_size() : mmio.cpp , mmio.h
• MOD : adler32.c
• MOD28 : adler32.c
• MOD63 : adler32.c
• mrewind() : mFILE.c , mFILE.h
• mstderr() : mFILE.h , mFILE.c
• mstdin() : mFILE.c , mFILE.h
• mstdout() : mFILE.h , mFILE.c
• mtaux_t : bgzf.c
• mungetc() : mFILE.c , mFILE.h